液相色譜儀常用的脫氣方法有如下幾種： 吹氦脫氣法使用在液體中比空氣溶解度低的氦氣，在0.1MPa壓力下，以約60ml/min流速通入流動相10-15min以驅除溶解的氣體。此法適用于所有的溶劑，脫氣效果較好，但在國內因氦氣價格較貴，本法使用較少。

    加熱回流法此法的脫氣效果較好。

    抽真空脫氣法此時可使用微型真空泵，降壓至0.05~0.07MPa即可除去溶解的氣體。顯然使用水泵連接抽濾瓶和G4微孔玻璃漏斗可一起完成過濾機械雜質和脫氣的雙重任務。由于抽真空會引起混合溶劑組成的變化，故此法適用于單一溶劑體系脫氣。對多元溶劑體系，每種溶劑應預先脫氣后再進行混合，以混合后的比例不變。

    超聲波脫氣法將欲脫氣的流動相置于超聲波清洗器中，用超聲波振蕩10-15min。但此法的脫氣效果差。

    在線真空脫氣法：

    以上幾種方法均為離線（off-line）脫氣操作，其會隨流動相存放時間的延長又會有空氣重新溶解到流動相中。現在使用的在線真空脫氣技術，把真空脫氣裝置串接到儲液系統中，并結合膜過濾器，實現了流動相在進入輸液泵前的連續真空脫氣。此法的脫氣效果明顯優于上述幾種方法，并適用于多元溶劑體系。

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